接着就把刚才的事简单说了一遍。
齐渝他们课题组遇到了麻烦，张丽芳教授最近身体不太舒服，数学建模那边推不下去，就联系了刘若传老师帮忙推荐个人，刘若传就推荐了顾铭。
“所以我就搞不懂了。”顾铭越说越来气。
“他们叫我来帮忙，我给了建议，不听就不听吧，还当面说我是错的。”
那边的程伟其实冷静下来以后也觉得自己刚才不太对。
毕竟人家确实是来帮忙的，就算意见不一样，也不至于当面怼人家。
只是他实在受不了顾铭那个劲儿。
一个学数学的，全程一副“你们化学就是低人一等”的嘴脸。
所以他也没说话。
顾铭说完以后，就看向李东。
“学弟，你给评评理。”
这下所有人都看向了李东。
李东笑着点了点头。
然后心里疯狂的MMP。
我评理？我怎么评理？
你刚才说的那些东西，数学部分我全听明白了。
确定性ODE拟合随机过程、马尔可夫SDE的构建逻辑，这些我都懂。
但化学那边的呢？
什么构象态跃迁，什么底物浓度反馈效应……
我连名词都没搞全，评个屁啊。
但毕竟他是青龙学习小组的群主。
装高人这一块，他自认为装得毫无破绽。
所以李东很自然地笑了笑，目光不经意地扫向了齐渝。
也不说话。
齐渝接到他的目光，面无表情。
但心里已经在疯狂吐槽了。
你是不是没听懂？
化学那部分你是不是完全没听懂？
他知道这个小学弟接触化学其实没多久，而且之前问的问题，和这个课题的方向也不一样。
估计是连名词都没搞明白吧。
齐渝在心里叹了口气。
所以她用尽可能简洁的语言，把化学这边的核心概念给李东捋了一遍。
酶的构象动力学是什么意思，就是酶分子不是一个刚性的球，它会在多个构象之间来回跳。
每个构象的催化效率不一样，而且跳来跳去不是完全随机的，前一个构象会影响下一个构象出现的概率。
这就是程伟说的“非马尔可夫”有记忆。
还有底物浓度的反馈，底物不是一个被动的背景参数，它会反过来改变酶的构象分布。
“简单来说就是，这个体系是动态的、有记忆的、会被环境反过来影响的。”
齐渝说完，看了李东一眼。
李东还是那副波澜不惊的表情。
但实际上他脑子里已经炸了。
0.4的基础属性全部拉满。
齐渝嘴里说的“构象跃迁有记忆”，在他脑子里自动翻译成了带记忆核的积分微分方程。
“底物浓度反馈”，翻译成了外场参数耦合进状态转移概率。
齐渝说完了。
李东在心里花了几秒钟把所有东西串了一遍。
他不可能完全理解这个课题的全部。
化学体系的实验细节他确实不懂，这么短的时间也不可能百分之百吃透。
能理解个八九成，已经很不错了。
但他们吵的那个点，他算是彻底明白了。
然后就有点无语。
不是……
你俩吵得这么激烈，原来是鸡同鸭讲啊？
顾铭说“确定性ODE拟合随机过程不靠谱”，对的，这是他的数学直觉。
谢晓亮院士二十多年前就用单分子荧光实验证实了这一点。
他抓住的是这个体系的数学本质。
程伟说“你那个马尔可夫模型忽略了记忆效应和底物反馈”也是也对。
实验上观测到的东西就摆在那里，不是你一句“数学直觉”就能抹杀的。
问题出在哪？
顾铭在说“你原来的工具选错了，得换”。
程伟在说“你换的这个新工具也不对，因为它不符合我们的化学体系”。
一个在攻击旧框架。
一个在否定新模型。
两个人说的根本不是同一件事。
李东看向顾铭。
“顾铭学长。”
“嗯。”
“你刚才说用确定性ODE去拟合本质随机的酶催化过程不可靠，这个判断我没什么意见。”
李东顿了一下。
“说实话，在场的化学组做了这么久的课题，都没发现ODE框架本身有问题，你一来就看出来了。”
“能这么快从一个化学体系的实验数据里，直接定位到底层数学框架的选择错误，这种洞察力不是随便什么人都有的。”
这话不是拍马屁。
因为它是事实。
顾铭愣了一下。
他当然被很多人夸过，但是很少有人能夸的这么……嗯，客观的。
而且还是被一个这么牛逼的大佬夸。
顾铭有一瞬间，甚至觉得自己被低估了。
要不……我也去投一下《数学年刊》？
就在他飘飘然的时候，李东问了一个问题。
“不过学长，我能问你个事吗？”
“你说。”
“你建的那个SDE模型，用的是标准马尔可夫假设吧？”
顾铭点头。
“嗯，那你觉得……”
李东的语气很随意，就像在聊天一样。
“如果一个体系里面，构象的弛豫时间比催化周转的时间长了不止一个量级……这种情况下，无记忆假设还成立吗？”
顾铭的表情变了。
马尔可夫过程的核心就是无记忆性。
但如果弛豫时间远大于周转时间……
那构象跃迁的历史路径就会对当前状态产生不可忽略的影响。
换句话说……系统天然就不是马尔可夫的。
那他用马尔可夫假设去描述一个非马尔可夫的系统……
数学上当然是自洽的。
但它描述的，已经不是眼前这个化学体系了。
顾铭一下子愣住了。
他也是天才。
在李东说完这句话的瞬间，他就全明白了。
程伟之前那些话……什么非马尔可夫跃迁，什么底物反馈效应，指的就是这个。
只不过程伟没办法用严格的数学语言把这件事讲清楚。
所以听起来就像是在用“化学直觉”否定“数学严谨”。
而他当时还在心里嘲笑，你连非马尔可夫过程的数学定义都说不出来，凭什么否定我的模型？
现在回头一看。
人家说的是对的。
只是翻译出了问题。
而且他不知道为什么，感觉自己的脑子突然比平时还清醒了几分。
顾铭也不管其他人了。
他转身走到白板前，一把拿起马克笔。
他把之前那个标准马尔可夫SDE的框架直接划掉了。
然后在旁边重新起笔。
构象跃迁不再用常数转移概率矩阵，而是改用半马尔可夫过程。
跃迁间隔的等待时间不再是指数分布，而是一般分布，天然就带记忆效应。
底物浓度不再是固定的背景参数，而是作为外场变量，显式地耦合进了转移概率的表达式里。
他写了将近二十分钟。
白板上密密麻麻全是公式。
写完以后，顾铭放下笔，仔细看着白板好像是在验证一样。
“哦……原来是这样。”
然后他转过身，看向程伟。
“你过来看一下。”
“构象跃迁用半马尔可夫过程建模，底物浓度作为外场耦合进转移概率。”
“如果按这个框架重新算的话，你们的实验数据应该能对得上。”
程伟走上前。
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